MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 6849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008340	GCT	2	6	2186280	2186285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_008340	TGA	2	6	2186292	2186297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_008340	GCC	2	6	2186312	2186317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_008340	GAA	2	6	2186323	2186328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_008340	CGG	2	6	2186373	2186378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_008340	CAG	2	6	2186467	2186472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_008340	CCA	2	6	2186493	2186498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_008340	CGGT	2	8	2186531	2186538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_008340	CAC	2	6	2186548	2186553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_008340	CGT	2	6	2186556	2186561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_008340	CGG	2	6	2186565	2186570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_008340	GAT	2	6	2186581	2186586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_008340	GTG	2	6	2186594	2186599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_008340	CAC	2	6	2186617	2186622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_008340	GGCG	2	8	2186657	2186664	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_008340	CTA	2	6	2186699	2186704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_008340	CCG	2	6	2187382	2187387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_008340	CTC	2	6	2188032	2188037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_008340	CGG	2	6	2188038	2188043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_008340	C	6	6	2188063	2188068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4521	NC_008340	G	6	6	2188074	2188079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_008340	T	7	7	2188081	2188087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_008340	CTC	2	6	2189919	2189924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_008340	CTT	2	6	2190767	2190772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_008340	GC	3	6	2190819	2190824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_008340	CCTG	2	8	2191631	2191638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_008340	AGC	2	6	2191714	2191719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_008340	ACC	2	6	2192169	2192174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_008340	GGC	2	6	2192177	2192182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_008340	CGGG	2	8	2192649	2192656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_008340	CAA	2	6	2192715	2192720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_008340	GCT	2	6	2196368	2196373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_008340	CGA	2	6	2196390	2196395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_008340	GGC	2	6	2196407	2196412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_008340	T	6	6	2196435	2196440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_008340	ACGA	2	8	2196464	2196471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_008340	CGG	2	6	2197656	2197661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_008340	GGAC	2	8	2198054	2198061	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4539	NC_008340	GCCC	2	8	2198144	2198151	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4540	NC_008340	GGC	2	6	2198161	2198166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_008340	TGG	2	6	2198181	2198186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_008340	GCC	2	6	2198608	2198613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_008340	TGG	2	6	2198674	2198679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_008340	GAAA	2	8	2200482	2200489	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_008340	CACCC	2	10	2200491	2200500	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4546	NC_008340	GGC	2	6	2200526	2200531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_008340	TGC	2	6	2200581	2200586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_008340	CTT	2	6	2200588	2200593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_008340	CAT	2	6	2200598	2200603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_008340	ATTC	2	8	2200702	2200709	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_008340	TTA	2	6	2200739	2200744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_008340	CCAC	2	8	2205388	2205395	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4553	NC_008340	GAT	2	6	2205461	2205466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_008340	CGGC	2	8	2206334	2206341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_008340	CCG	2	6	2206362	2206367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_008340	GGCC	2	8	2207104	2207111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_008340	CAA	2	6	2208224	2208229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_008340	GGCC	2	8	2208271	2208278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_008340	CA	3	6	2208431	2208436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_008340	CGC	2	6	2209289	2209294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_008340	GGCC	2	8	2209308	2209315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4562	NC_008340	GAG	2	6	2209333	2209338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_008340	CCG	2	6	2209343	2209348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_008340	CGGG	2	8	2210668	2210675	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4565	NC_008340	CGC	2	6	2210676	2210681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_008340	CTT	2	6	2210719	2210724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_008340	CAG	2	6	2210740	2210745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_008340	GGC	2	6	2212971	2212976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_008340	GCC	2	6	2213334	2213339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_008340	CT	4	8	2217357	2217364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4572	NC_008340	TCC	2	6	2219488	2219493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4574	NC_008340	CGA	2	6	2219581	2219586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4576	NC_008340	GGCC	2	8	2219669	2219676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_008340	G	6	6	2219682	2219687	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_008340	CCG	2	6	2219728	2219733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4580	NC_008340	GAG	2	6	2220260	2220265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_008340	GCC	2	6	2220313	2220318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_008340	GCC	2	6	2223108	2223113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4583	NC_008340	TGG	2	6	2223149	2223154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_008340	TGT	2	6	2223207	2223212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_008340	CGG	2	6	2223308	2223313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_008340	CCA	2	6	2223326	2223331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_008340	TGT	2	6	2224615	2224620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_008340	T	7	7	2224651	2224657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_008340	TCC	2	6	2225411	2225416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_008340	AGG	2	6	2225426	2225431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4592	NC_008340	GCC	2	6	2227336	2227341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_008340	CCTG	2	8	2228893	2228900	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_008340	GTT	2	6	2231189	2231194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4596	NC_008340	CG	3	6	2231866	2231871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_008340	GC	3	6	2231878	2231883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_008340	GGT	2	6	2231914	2231919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_008340	CT	3	6	2240484	2240489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_008340	CCGGC	2	10	2240505	2240514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4601	NC_008340	GCT	2	6	2240534	2240539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_008340	CTTTT	2	10	2240587	2240596	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4604	NC_008340	GGT	2	6	2240702	2240707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_008340	GGC	2	6	2241196	2241201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4607	NC_008340	GAA	2	6	2241993	2241998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_008340	CCA	2	6	2246254	2246259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_008340	G	6	6	2247946	2247951	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_008340	GGGA	2	8	2252908	2252915	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_008340	CGC	2	6	2252998	2253003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_008340	ATC	2	6	2253062	2253067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_008340	GCC	2	6	2256190	2256195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4614	NC_008340	CGC	2	6	2256216	2256221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4618	NC_008340	CTT	2	6	2256697	2256702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4620	NC_008340	CACC	2	8	2256798	2256805	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4621	NC_008340	GCC	2	6	2256822	2256827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_008340	CAA	2	6	2256835	2256840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_008340	CGGGG	2	10	2258101	2258110	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4624	NC_008340	CGA	2	6	2258112	2258117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4626	NC_008340	CAC	2	6	2258750	2258755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_008340	GTT	2	6	2258763	2258768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_008340	CG	3	6	2260236	2260241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_008340	GCG	2	6	2260293	2260298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_008340	TCACC	2	10	2263014	2263023	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4766	NC_008340	CACC	2	8	2346735	2346742	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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4863	NC_008340	GCT	2	6	2391204	2391209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4882	NC_008340	TGA	2	6	2398340	2398345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4890	NC_008340	TGC	2	6	2399233	2399238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4895	NC_008340	GCCCT	2	10	2399428	2399437	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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